«Помнишь, когда у тебя были крылья». В ответ на желание, загаданное 12 000 лет назад, соединяются разбитые сердца. Когда встречаются солнце, луна и Марс, рождается новая мелодия слияния! Эношима — небольшой остров, затерянный в водах моря Сёнан. На его прекрасном и безмятежном побережье располагается «Частная академия Эношима». Сюда со всей страны съезжаются одарённые дети, чтобы получить особое образование с использованием новейшего оборудования. Сакко Отори, Римия Цукисиро и Тоси, отобранные для обучения в специальном классе усиленной подготовки «Элементы», получают приказ пилотировать «Вектор-машину» — боевой аппарат, работающий на силе эмоций, — и вынуждены сражаться с таинственным оружием вторжения, именуемым «Мифическими зверями». Посреди сражения, ведомая загадочным видением, Сакко выкрикивает: «Слияние планет! Вперёд, Аквариус!» После череды бесконечных перерождений на свет является механическое небесное крыло — Аквариус. Юноши и девушки, несущие бремя своей судьбы, вскоре столкнутся с истиной мироздания, когда пересекутся пути таинственной организации «Космическое яйцо» и замыслов взрослых... Это грандиозный миф о любви, сотканный из собственных чувств героев, где на кону стоит судьба всей Вселенной.