Действие данного сезона разворачивается в 2055 году, спустя 4 года после событий "Хроники карточных битв W". LBXs становится крупнейшим мировым хобби: учреждаются профессиональные лиги, а многие люди готовы посвятить LBX всю свою жизнь. 14-летний Арата [瀬名アラタ] - новый студент по обмену в академии Камуи Даймон, которая находится на острове Камуи недалеко от Японии. Академия известна во всем мире как лучшее учебное заведение для повышения квалификации LBX-игроков, а потому и попасть туда не так уж и легко: в условиях сильнейшей конкуренции желающий стать студентом новичок должен одержать не менее 3 побед в официальных турнирах. Вместе с другими членами своей команды Арата сталкивается с серьезными соперниками и начинает постепенно приоткрывать завесу тайн, скрывающихся в академии...