Действие происходит в мире, перенесенном на 100 лет в будущее, за несколько лет до того, как Лиза и Лорна присоединились к организации eX-D. Мир, где люди управляют управляемыми компьютером электрическими "автомобилями с искусственным интеллектом", которые автоматически доставляют вас туда, куда вы хотите попасть. Однако одна машина с искусственным интеллектом таинственным образом начинает выходить из себя. Теперь Нине и Рэй Кадзама, как главным водителям организации ex-D, предстоит разгадать тайну машины с искусственным интеллектом, в которой их поджидает злой заговор и ловушка...